对于已经入库的食品，需要按照食品的不同种类和不同的冷加工最终温度分别存放。如果冷藏间较大，而某种食品数量较少，单独存放不经济时，或冷藏间少而需要贮存的食品种类较多，不可能单独存放时，可以考虑不同种类的食品混合存放，但应以不互相串味为原则，并应分别堆码。具有强烈气味的食品如鱼蒜、葱、乳酪等和贮藏温度不一致的食品，应严格禁止混放在一个冷藏间内。可以混合堆放的食品见表10-3中所列的六大类。注意同类的食品可以混合贮藏，不同类之间的食品则不能混合贮藏。未列入表中的食品应单独存放。
冷库中的食品应按照不同品种放在清洁的垫仓板或托盘上，要求商品不能超出垫板或托盘四边，码放整齐，标识清楚，且需要留出1~2cm，禁止直接放在地上。货堆上应覆盖芦席或篷布，以免灰尘、霜雪落入而污染食品。垛与墙之间留有15cm，垛与垛之间应留有20cm的间隙，便于空气的流通。如是不同种类的货堆，其间隙应不小于70cm。库内留有合理的走道，便于库内操作、车辆通过设备检修，并保证安全。食品在堆码时，应与墙壁或排管有一定距离，以免损坏设备和使冷却贮藏的食品冻坏或过度干缩。
在冷藏过程中，应经常对食品进行检查，并定期对食品、冷藏间的空气进行测定和分析，以检查微生物污染的情况。如发现有软化、霉烂、腐败变质和感染等情况，应及时采取措施，分别加以处理，以免感染其他食品造成更大损失。库内的食品全部出库后，应对库房进行通风换气，利用风机排出库内的浑浊气体，换人经过滤的新鲜空气。
