气调库的进出货和贮藏中的管理。在气调库进货前应事先检查库房的整体情况，如检查所有温度探点的精度、库体的密封性能、所有气体取样管道有无泄漏，以及检查所有气体分析仪器和控制器的能否正常工作。货物人库存前还应用无毒、无害、无腐蚀性的液体清洗或熏蒸库房和贮藏盛放容器来进行消毒，也可用臭氧或紫外光进行。为保证货物能整齐有序地堆放，可事先根据果蔬盛放物的尺寸，在地坪上规划好堆放位置。然后进行空库降温，以预先排除围护结构的蓄热，减少果蔬入库后总的热负荷，均衡冷却设备的负担，以利于制冷系统的安全运行。
果蔬运抵后应进行挑选，将伤残的、次的和有虫的剔除，然后应尽可能快地让其入库，单间气调库的入库时间应控制在3一5天，最长不能超过7天。在装货期间应随时检查装货的均匀及装满程度，并将温度探点均布在整个库房中。装满后，关门降温，等到库温和果蔬的温度基本达到贮藏温度时，开始封库贮藏。同时，开始降氧操作，考虑到降氧的同时也应使二氧化碳的浓度尽快升到最适浓度，要依靠果蔬的呼吸来增大库内的二氧化碳浓度，因此在封库降氧时，不必将库内的氧气浓度一下降到要求浓度，而应比要求浓度高2%~3%，再利用果蔬的呼吸来消耗掉这部分过量氧气。
按照气调贮藏的要求，果蔬贮藏期间温度波动的范围应控制在0.5℃以内，氧气、二氧化碳浓度变化也应控制在0.5%以内，乙烯浓度控制在允许值以下，相对湿度应保持在90%~95%。贮藏期间应每月两次对果蔬取样检查。
根据市场需要，果蔬要出货时，要事先做好开库前的准备工作。为诚少低氧对工作人员的危害，在出库前要提早24h解除气密状态，停止气调设备的运行，并
通过自然换气的方法使库内气体恢复到空气成分。当库门开启后，要十分小心，在确定库内空气为安全值前，不允许工作人员进入。对于气调库而言，经营方式以批发为主，每次的出货量最好不少于单间气调库的贮藏量，做到开一间，销一间。
尽管气调库在诸多方面有其独特的要求，造价也高于高温库，但由于其良好的果蔬贮藏效果，仍受到世界各地的普遍欢迎，在我国也有广阔的应用前景。
