1. 运输条件受制约
我国医药公司普遍采取的小批量、多批次的发运方式，决定了其很难实现冷藏品的规模集运，这也给选择物流公司带来了困难。我国医药企业最头疼的一个物流管理问题就是冷藏品不好运输和托运。尤其是一些物流市场不发达的二线城市，社会物流企业普遍不具备冷藏品运输的条件，因此许多医药企业明确规定，冷藏品不得托运。这也体现出我国冷链物流落后制约我国医药配送业务发展的弊端。
2. 药品质量监控欠缺
医药产品由于不同于其他物品，在物流配送方面也不同于一般产品，有着严格的温度控制规定（即需要全程冷链，保持2℃~8℃恒温）。但目前中国冷链体系仍然存在缺乏统一行业规范、实时监控体系缺位、缺乏完善的追溯机制、行业恶性竞争等问题，难以保证药品的质量。在质量监控这一块有待规范。
3. 冷链物流标准有待完善
现国家标准《物流术语》中对冷链的定义是“为保持新鲜食品及冷冻食品等的品质，使其在从生产到消费的过程中，始终处于低温状态的配有专门设备的物流网络”，并定义了温度保持在0℃~10℃范围内的仓库区域为冷藏区，温度保持在0℃以下的仓库区域为冷冻区。冷链包括低温加工、低温运输与配送、低温储存、低温销售四个方面。在国外，冷藏链的概念最早由美国人阿尔贝特·巴尔里尔（Albert Barrier）和英国人J.A.莱迪齐（J.A.Ruddich）于1984年先后提出。“供应链包括从原材料阶段到最终用户阶段的与货物的流动与转化有关的一切活动，供应链管理就是通过增强供应链成员间的关系来整合这些活动，以达到可持续发展的战略优势。”
