传热方式正如前述，配成溶液的药品在瓶（或托盘）中冻结后成为与瓶（或盘）紧密接触的冰团。冰的导热性能较好，因而一般医药冻干机目前定型为药品瓶（或托盘）直接放在能制冷和加热的搁板上进行预冻和干燥。为了使传热良好，要求搁板平整光洁，其不平度公差小于1mm/m，许多厂家还生产抽底托盘，让制品瓶直接放在搁板上。而固态食品为置于托盘中的松散堆积物，食品间有空隙，在真空下其导热性能很差。因此周态食品冻干机（亦可加工液态食品）目前定型为托盘悬置于两辐射加热板之间的形式。这种方式的辐射加热板温度比搁板高、干燥快、效率高。为了增强辐射放热，要求加热板两表面的辐射系数高达90%一95%以上。至于加热板的平整度，要求就不那么严格，但必须保证装料后，托盘底（包括支架）和物料顶与辐射板上、下两表面间有足够的距离（如不小于5~10mm）。
