冷藏车制冷方式有多种，以下五种是较常用的制冷方式：
水冰及盐冰制冷：水冰制冷装置投资少，运行费用低，但是普通水（盐）冰单位质量的吸热量较小，车厢内降温有限，而且盐冰融化后会污染环境、食品，腐蚀车厢和货物受潮，因此水（盐）冰制冷主要用于鱼类等水产品的冷藏运输。
干冰制冷：装置简单、投资和运行费用较低、使用方便、货物不会受潮。干冰升华产生的二氧化碳气体能抑制微生物繁殖、减缓脂肪氧化以及削弱水果蔬菜的呼吸。但是，干冰升华易引起结霜，二氧化碳气体过多则将导致水果、蔬菜等冷藏物呼吸困难而坏死。而且厢内温度难调，干冰成本较高，且消耗量较大，故实际应用较少。
冷板制冷：装置本身较重、体积较大，占据了车厢的一定容积，而且冷板充冷一次仅可持续工作8~15小时。因此，冷板制冷适用于中、轻型冷藏汽车的中、短途运输。近年来，随着能源和环境污染问题日益突出，冷板制冷的应用发展较快，已成为仅次于机械制冷的制冷方式。
液氮制冷：装置结构简单、工作可靠，无噪声和污染；液氮制冷量大、制冷迅速，适于速冻。液氮汽化不会使厢内受潮，并且氮气对食品保鲜、防止干耗均有好处。此外，液氮制冷控温精确（±2℃）。但是液氨成本较高，需经常充注，因而推广受到一定限制。同理，其他低温汽化的液态气体，亦可作为制冷剂，如液态二氮化碳。
机械制冷：机械制冷方式有蒸气压缩式、吸收式、蒸气喷射等。目前以蒸气压缩式应用最为广泛。压缩式制冷机组主要由压缩机、冷凝器、节流阀（或膨胀阀）和蒸发器等组成。
