使用机械冷藏车运输时，应在途中每隔一定时间做好温度记录。铁路规定记录温度的间隔为2h，并每隔6h填写一次冷藏车作业单。一般机冷车的温度控制可自动进行。故温度管理反而简单。
在使用加冰冷藏车时，车内的低温靠冰的消耗来维持。在运输距离较长时，往往需要中途加冰。因此，铁路、加冰冷藏车必须按指定路线在有中途加冰所的线路上运行，有时，为此目的需绕道运行。
加冰冷藏车的途中加冰作业主要为，在始发站根据列车的热消耗预测冰消耗量，并向前方加冰所发出加冰预报。到达加冰所后，应即检查车内温度、残冰情况，并按需要量加足冰或冰盐。同时向下一个加冰所或到站发出预报。
在长途运输中，往往运输沿线的外界气温有很大差别。如在10月份由广州往满洲里运香蕉，广州的平均外温为23℃，满洲里为0℃。在这种情况下，往往要视具体情况，先用冷藏运输，在途中的适宜区段采用不制冷的保温运输或通风运输，而在严寒地段降温超过允许幅度时，则要采用加温防寒运输，以保证货温的稳定。
