冷藏集装箱可广泛应用于铁路、公路、水路和空中运输，是一种经济合理的运输方式。使用冷藏集装箱运输的优点如下：
(1)装卸效率高，人工费用低:采用冷藏集装箱，简化了装卸作业，缩短了装卸时间，提高了装卸负荷，降低了运输成本。
(2)调度灵便，周转速度快，运输能力大，对小批量冷货也适合，
(3)大大减少甚至避免了运输货损和货差。冷藏集装箱运输在更换运输工具时，不需要重新装卸食品，简化了理货手续，为消灭货损、货差创造了十分有利的条件。
(4)提高货物质量:箱体内温度可以在一定的范围内调节，箱体上还设有换气孔，因此能适应各种易腐食品的冷藏运输要求，保证易腐食品的冷藏链不中断，而且温差可控制在±1℃之内，避免了温度波动对产品质量的影响，实现从“门到门”的运输。
