水路运输的优点是行驶平稳,由振动引起的损伤少、运量大、运费低廉。它作为果蔬产品在集散地的短途驳运效果很好,但水路运输限制在水网地带及沿海,而且,在我国内河水路运输的中转环节较多,等待时间长,运输速度慢,影响果蔬产品的质量。海上运输在国外发展很快,许多岛国海上运输是其主要形式,多以外置式冷藏集装箱及冷藏船为运输工具。尤其是大型船舶的动力、能源供应充足,这为果蔬运输中的迅速预冷及精确控制运输温度提供了便利条件。因此,运输质量很高,果蔬的国际贸易,主要是靠海上冷藏运输。目前,我国也正在大力发展海上运输。