1.冷却效果与品种有关 真空冷却效果与农产品的表体比(表面积与体积之比)有关，表体比大的产品，如菠菜、结球生菜、莴苣、甜玉米等效果十分明显。对表体比小的产品如黄瓜、番茄、马铃薯冷却效果就较差，但使用带有喷雾加湿的真空冷却装置冷却，这个问题就可得到改善。
2.设备成本较高 以往由于真空冷却装置的制造成本较高，影响推广使用。随着科学技术的进步和配套设备价格的下降，近年来加速了真空冷却装置的推广应用。因为这可从它冷却速度快，保鲜效果好，设备利用率高等方面得到补偿，对农产品出口创汇和优质食品生产，效果尤为明显。
