冷藏运输制冷装置与陆地冷库装置的工作原理、结构基本上是相同的，但冷藏运输船的特殊要求有以下4点：
1)冷藏运输船货舱必须具有良好的隔热与防潮设施。船舶结构特殊，有金属骨架突入隔热层中而造成热流短路(冷桥)，将对冷藏产生极为不利的影响。故在同样的隔热层装置中，冷藏运输船货舱外围护结构的单位面积渗入热比陆地冷库大得多，在突入隔热层中的金属骨架外面(即靠冷藏货舱一侧)，至少需要相当于50mm厚的聚氨酯发泡隔热层，以防止外表面凝水和减少冷量过分损耗。此外，冷藏运输船货舱在使用时，有时会出现冷藏货舱气压高于隔热层内部气压的现象，这样冷藏货舱中的水蒸气会从隔热层表面渗入隔热层内部，因此冷藏运输舱的外围护结构必须有良好的防潮和隔气设施。
2)冷藏运输船的制冷压缩机及辅助设备在重量、体积、安全可靠性及备件方面，均比陆地的制冷设备有更高的要求。这是因为冷藏运输船在航行中只能作简单的维修，一旦制冷装置发生故障而又难以排除时，有可能造成巨大的损失。
3)冷藏运输船的制冷压缩机及辅助设备还要求船舶在纵倾10°，横倾15°、振动以及在高温、高湿条件下，均能够正常工作，凡与盐雾接触的部件，要求耐腐蚀或采取防腐措施。
4)冷藏船的制冷装置，必须设置备用的制冷压缩机(包括发动机)和其他辅助设备，以保证制冷装置能够在任何一台制冷压缩机或设备损坏的情况下，仍能维持正常的冷藏温度。
