果蔬人库后，盛装果蔬的容器的品种、数量和堆垛的方式不同等都与储藏效果和库容量的利用率有关，并且直接影响气调储藏的经济效益。
1.盛装果蔬容器
无论采用哪种容器盛装果蔬，装箱时都不宜过满，以免堆码时压伤果实。果箱装满后即可用电瓶铲车或电瓶板车运输入库。
2.入库品种
在同一间储藏室内应入储相同品种、相同成熟度的果实。如果一个品种不能充满储藏室而要用其他品种补足时，应储入相同采收期和对储藏条件有相同要求的品种。绝不允许将不同种类、不同品种的水果或蔬菜混放在同一间储藏室内.以免释放的乙烯及其他有害气体相互影响储藏品质。
3.入库数量
果蔬人库时不宜一次装载完毕，果蔬释放的田间热和呼吸热加上冷库门长时间开放引入外界的大量热量会使库温升高，并使库温在很长时间内降不下来，从而影响储藏效果。因此要分批入库，且每次入库量不应超过库容总量的20%，库温上升不应超过3℃。对已经预冷处理过的果蔬，每次的入库数量可以酌情增加。
4.堆码
储藏箱堆码时，要求整齐、规格化，垛的大小要适宜，过大会影响通风，造成库内温度不均匀，垛太小将降低库容量，提高储藏成本。垛与库壁至少相距20 cm，垛高不能超过冷风机的出风口。垛与垛之间要留有20-30 cm间距，堆垛的行向应与空气流通方向一致。如果库房体积不大，每垛中箱与箱之间要留有1.5~2 cm宽的间隙，库内还应留有适当宽度的通道，以利于工作人员和载重车出入。堆码时要离蒸发器2m距离，因蒸发器附近的温度过低而时常会产生低温伤害。
堆码时除留出必要的通风和通道之外，应尽可能地将库内装满以减少库内气体的自由空间，从而加快气调速度、缩短气调时间，使果蔬在尽可能短的时间内进入气调储截状态。
5.气调库生产前的准备工作
气调库生产前的准备工作主要有：给水封安全阀注水，将安全阀的水封柱高调节到24.5 Pa(25 mmH₂O)时较为合适，校正好遥测温度、湿度以及气体成分分析的仪器；检查照明设备；给所有进、出库房的水管道(如冲霜、加湿、溢流排水等)的自封注水。
