冷库内存放的物品多数都是食品，冷库因为需要经常进出货物。不可避免地会有细菌进人到冷库中，虽然冷库内的温度很低细菌不容易生长，但时间长了细菌还是会滋生。使冷库产生异味，让食品受到污染。所以冷库内的消毒工作就非常必要了。
冷库库房内部的消毒要求是：为做好冷库卫生管理工作，保证食品和烹饪原料的冷藏质量，要定期(每月一次)进行冷库卫生消毒工作。冷库进行除霉杀霉与消毒操作时，可先用酸类消毒剂进行消毒处理。酸类消毒剂的杀菌作用主要是凝固菌体中的蛋白。常有的消毒剂有乳酸、过氧己酸、漂白粉、福尔马林等。
