气调库在做到气密要求后是基本密封的，因结构强度的关系，库内气压不应超过180 Pa。而库内温度变化会造成库内压力的变化，会使围护结构的两侧产生压差。这种压差如不能及时消除或控制在一定的范围内，将会对围护结构产生危害，轻则破坏围护结构的气密层而降低气密性，重则会造成围护结构的胀裂或塌陷的重大事故。因此，对气调库来说库体的安全也是个不容忽视的问题。
气调库的安全措施主要是设置安全间和气调帐，这样可以防止库内产生过大的正压和负压，缓解库内外的压差，使建筑结构和气密层免透破坏。气调库出现库内压力变化的原因有库内温度的波动、冷风机周期性的开停、制冷盘管的除霜、二氧化炭脱除设备脱除了二氧化碳等。
安全间的实质是一个水封装置，设置在气调库的侧板上，一般是在穿堂侧。在气调库的使用中，安全阀内始终保持一定水柱(冬季为防止冻结，也可用盐溶液等不冻液代替)高度的封闭液体，以隔断库内外气体交换。一般控制的水位差为25 mm.
气调储藏中，放满果蔬后库房容积利用率一般为0.7。根据查理定律，当压力恒定时，体积与绝时温度成正比，如果库温变化1℃，则容积变化0.25%。若库温变化缓慢，通过安全阀就可以补偿压力或体积的改变而不需进入过多的室外空气；若库温波动频繁，库内气体的排除和库外气体的吸入也会频繁，从而造成库内气体成分不稳定。在此情况下，可以通过设置气调帐的办法来解决。气调帐的容积可按空库容积的0.5%一1%确定，材料可选用增强聚乙烯塑料，设置在每间气调间的顶部外侧。当冷风机融霜时，库内温度升高，引起库内气体体积膨胀，气调帐被膨胀气体充满：当室内温度降低时，库内气体体积冷缩，袋中原先进入的气体代替库外新鲜空气被吸入库内，这样就可以减少库内氧气浓度的升高。国外也有将气调帐和安全阀用同一根聚氟乙烯管子引出的。
