1)转子加工困难。转子的加工精度要求高，加工比较困难，需要专用设备。
2)辅助设备庞大。对于喷油的螺杆式压缩机，为了分离排气中的润滑油，需要有体积大、结构复杂、效率高的油分离器和回油装置。
3)噪声大。由于转子齿槽周期性地高速通过吸、排气孔口，以及通过缝隙的泄漏等原因，噪声较大。一般如果机房里设置的都是螺杆式制冷压缩，则机房不要紧靠主库或其他车间，最好应离开其他建筑物单独布置，消声相对较好。最好机房与设备操控室做消声隔开设置，以减少对操作人员的噪声干扰。
螺杆式制冷压缩机目前适用于氟利昂空调以及单级、双级(-40℃)系统中。在大、中型(制冷量在350kW/h以上)的场合，优点较突出。
