较大渔船的冷冻机房，采用氟利昂制冷剂的制冷设备一般设置在渔船机舱内，且必须设有良好的通风换气设备、消防设备和检测仪表、仪器，采用所制冷剂的冷冻机舱最好单独设置，且应配备操作防护服、防毒用具(包括洋气呼吸器)及配置有专用药品等，制冷系统应安装安全设施、信号器和事故提示，机房还应安装漏氨消防设备。渔船的制冷系统应尽量不要采用氨作为制冷剂，以确保生产安全。
渔船机舱因设置有各种主机、辅机和其他机械，这些机械会发出大量的热量使机舱温度升高，加上水蒸气、油蒸气及油漏的制冷剂等，使机舱的空气污浊，因此机舱要设置通风系统，保持机舱有一定的新鲜空气，使机舱维持适当的温度和湿度。通风系统主要有风机、风管、吸风口及排水口等。
渔船机舱通风一般采取机械送风，自然排风方式。机舱通风应保证有一定的送风量，使机舱工作区间的温度与外界温度偏差的绝对值为5~8℃。机舱内一般采用各种回转变向的喷射式送风设备。
