每批冷藏食品在进入库冷加工之前，都必须进行严格的质量检查，包括随货同行的出厂卫生证件等，不符合食品卫生的和有腐败变质、有异味迹象的食品，不能进行冷加工生产，也不能进入冷库贮藏。
食品要进入冷库，应按照食品的不同种类、温度要求尽量分别存放。如果不同种类的食品混合存放，应考虑以不互相串味为原则。具有强烈气味的食品，如鱼、葱、冰激凌等应存放在专门的冷藏间。对进入冷库的食品，应经常进行质量检查，发现有超期存放或有质变迹象的物品，应及时采取措施，分别加以处理，以免污染其他物品。同时，应及时向领导反映并向贮存货物的客户书面通知货物及时出库，以免食品变质扩大，造成更大的损失和经济纠纷。
在正常情况下冷库内的食品全部出库后，如果是高温库(正温库)库房应通风换气，利用风机排除库内的混浊空气，换入经过滤的新鲜空气，同时对冷风机进行冲霜。如果是低温库则应及时对车发器进行冲霜、扫霜，对库房进行清扫，并保持规定的温度，以利于下次随时能进货。
