利用清洁的自来水以较大的水流速度（不小于1.5/s）对与冷却水接触的所有设备和管道进行5h~8h的循环冲洗，借助水流的冲击力和洗刷力来清除设备和管道中的泥砂、松散沉积物和各种碎屑杂物，并通过主管道的最低点或排污口排放掉清洗水，同时拆洗Y型水过滤器。
由于热交换器内的换热铜管管径较小，为避免系统清洗出来的污泥杂物堵塞换热管，清洗水应从热交换器的旁路管通过。热交换器的清洗则采用拆下端盖，单独用刷子和水对每根换热管进行清洗的方法。
物理清洗的优点是：可以省去化学清洗所需的药剂费用；避免化学清洗后清洗废液的处理或排放问题；不易引起被清洗的设备和管道腐蚀。存在的缺点是：部分物理清洗方法需要在中央空调系统停止运行后才能进行；清洗操作比较费工；有些方法容易造成设备和管道内表面损伤等。
